More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0267 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  100 
 
 		 325 aa  659    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  61.68 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  60.75 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  57.94 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  57.94 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  58.88 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  58.15 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  58.07 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  57.1 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  58.04 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  54.18 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  53.99 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  53.35 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  56.48 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  53.99 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  53.99 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  56.74 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  53.14 
 
 		 318 aa  342  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  48.31 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  50.96 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  50.16 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  47.62 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  49.21 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  50.16 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  51.15 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  51.15 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  43.65 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  47.17 
 
 		 322 aa  305  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  46.95 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  45 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  46.35 
 
 		 316 aa  281  9e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  42.27 
 
 		 342 aa  249  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  42.68 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  42.67 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  42.12 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  40.58 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  45 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  40.99 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  39.56 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  38.89 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  37.96 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.51 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  37.25 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  40 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  45.63 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  35.69 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  61.94 
 
 		 940 aa  195  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  33.04 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  34.39 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.52 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  29.74 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  32.95 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  30.64 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  31.25 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  28.06 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  30.05 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  29.89 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  38.6 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  31.2 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  28.24 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.98 
 
 		 517 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.31 
 
 		 478 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.92 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  33.14 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  38.35 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.28 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.75 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  32.84 
 
 		 600 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  35.38 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  34.55 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  37.1 
 
 		 497 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  31.95 
 
 		 575 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  34.84 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.88 
 
 		 529 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  32.08 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  35.38 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.4 
 
 		 602 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.17 
 
 		 588 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  27.79 
 
 		 548 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.04 
 
 		 627 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 569 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  36.89 
 
 		 497 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  34.57 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  30.47 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.83 
 
 		 534 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  29.74 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  32.93 
 
 		 631 aa  105  9e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.41 
 
 		 595 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  34.95 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  30.38 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  33.21 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.08 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.51 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.43 
 
 		 584 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>