More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0262 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  65.58 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  60.74 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  60.34 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  59.66 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  57.77 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  55.74 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  55.74 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  55.74 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  55.41 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  60 
 
 		 326 aa  364  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  56.04 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  57.88 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  56.48 
 
 		 322 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  56.76 
 
 		 322 aa  351  7e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  55.81 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  54.9 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  50.16 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  49.33 
 
 		 330 aa  311  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  48.33 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  47.96 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  50 
 
 		 348 aa  289  4e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  48.75 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  47.62 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  48.8 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  46.26 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  47.57 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  46.53 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  46.18 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  46.18 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  42.28 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  36.81 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  42.33 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  40.6 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  36.67 
 
 		 338 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  38.97 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  40.4 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  42.98 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  35.28 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  38.33 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  34.92 
 
 		 322 aa  199  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  33.1 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  34.04 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  33.75 
 
 		 398 aa  192  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  38.51 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  35.08 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  37.86 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  51.79 
 
 		 940 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  33.86 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.68 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.35 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  31.46 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  31.01 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  31.25 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  32.3 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  29.43 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  31.89 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  34.62 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.07 
 
 		 575 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  36.06 
 
 		 356 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  30.84 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  29.39 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.4 
 
 		 478 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.4 
 
 		 478 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  27.78 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 		 462 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.66 
 
 		 732 aa  99.4  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.46 
 
 		 517 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  28.46 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  28.7 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.26 
 
 		 569 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.12 
 
 		 589 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.88 
 
 		 447 aa  95.9  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.57 
 
 		 594 aa  95.9  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.7 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.03 
 
 		 586 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.12 
 
 		 559 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.28 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 518 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  27.54 
 
 		 669 aa  94.7  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 		 625 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.02 
 
 		 565 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.02 
 
 		 565 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.8 
 
 		 540 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  27.42 
 
 		 579 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  29.41 
 
 		 629 aa  92.8  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.7 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  25.67 
 
 		 568 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.82 
 
 		 522 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29 
 
 		 602 aa  91.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  31 
 
 		 451 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.24 
 
 		 586 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.5 
 
 		 584 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>