More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49374 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  100 
 
 		 349 aa  725    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  59.05 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  58.28 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  55.24 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  58.13 
 
 		 289 aa  342  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  43.85 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  43.53 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  41.01 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  40.43 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  38.51 
 
 		 341 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  44.76 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  40.19 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  40.68 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  41.94 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  41.19 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  41.03 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  40.49 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  42.58 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  39.74 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  38.46 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  39.94 
 
 		 315 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  39.31 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  39.94 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  38.54 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  40.51 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  45.32 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  39.49 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  40.87 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  39.13 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  38.94 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  40 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  39.32 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  39.87 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  39.3 
 
 		 329 aa  215  8e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  38.66 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  40.45 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  39.55 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  42.21 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  34.86 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  33.7 
 
 		 398 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  45.37 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  37.17 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  46.83 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  45.09 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  36.79 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  38.17 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  47.06 
 
 		 940 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  29.35 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  28.44 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  28.19 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  32.31 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  27.27 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  27.43 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  34.12 
 
 		 642 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.73 
 
 		 735 aa  106  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  32.85 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.31 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  29.86 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  29.18 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.83 
 
 		 755 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 		 497 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  30.29 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.25 
 
 		 900 aa  100  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  32.42 
 
 		 807 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  26.97 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.01 
 
 		 517 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  25.65 
 
 		 568 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.79 
 
 		 478 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.98 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  30.3 
 
 		 437 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  25.17 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.33 
 
 		 575 aa  97.1  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.48 
 
 		 478 aa  96.3  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  26.16 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  33.02 
 
 		 497 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.87 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  27.82 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  29.85 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.19 
 
 		 467 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.04 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.39 
 
 		 600 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.04 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  28.74 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  30.12 
 
 		 499 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  31.92 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  26.57 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  29.73 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  29.24 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  30.33 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.24 
 
 		 554 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  34.25 
 
 		 454 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.83 
 
 		 621 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  31.07 
 
 		 451 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  31.75 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.72 
 
 		 589 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  24.74 
 
 		 602 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  28.76 
 
 		 423 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.37 
 
 		 569 aa  89.4  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>