More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0003 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  83.89 
 
 		 422 aa  738    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  100 
 
 		 422 aa  852    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  78.67 
 
 		 421 aa  708    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  82.7 
 
 		 423 aa  751    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  45.26 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  42.99 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  37.66 
 
 		 405 aa  247  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  35.06 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  35.49 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  33.87 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  34.36 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  33.25 
 
 		 484 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  32.7 
 
 		 642 aa  223  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  32.49 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  32.65 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  32.99 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  30.96 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  32.99 
 
 		 507 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  30.81 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  30.75 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  34.17 
 
 		 500 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  30.83 
 
 		 476 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  30.2 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  29.12 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  30.05 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  30.3 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  29.47 
 
 		 481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.97 
 
 		 385 aa  160  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.09 
 
 		 892 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  24.57 
 
 		 498 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  26.83 
 
 		 1001 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  29.43 
 
 		 942 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  27.24 
 
 		 1092 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.73 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  30 
 
 		 322 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  24.15 
 
 		 764 aa  97.4  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  31.6 
 
 		 320 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  28.03 
 
 		 1015 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  30.92 
 
 		 319 aa  92  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.04 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  28.88 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  34.08 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.34 
 
 		 318 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  31.6 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.47 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  32.6 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  33.04 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  30.94 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  28.76 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  26.32 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  29 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  32.16 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  32.43 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  30.77 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  28.7 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  29.15 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  30.13 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.33 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.6 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  28.12 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  23.66 
 
 		 993 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  27.5 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  25.41 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  25.36 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.7 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  25.78 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.35 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  27.14 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  30.42 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.7 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  27.14 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.54 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.26 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  28.27 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  28.16 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  26.01 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  27.37 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  27.8 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  26.34 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  25.99 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  26.33 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.67 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  26.5 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  28.17 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  25.31 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  24.9 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  23.79 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  29.38 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  23.79 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  26.88 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  28.9 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  26.16 
 
 		 599 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.57 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  26.73 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  29.59 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  30.22 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  26.91 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  27.87 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  28.39 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  31.06 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>