More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0736 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 432 aa  860    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  80.05 
 
 		 425 aa  647    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  67.72 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  54.78 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 442 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  54.27 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  54.16 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  53.96 
 
 		 440 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  56.9 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 		 447 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  52.46 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  54.55 
 
 		 505 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  54.07 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  55.95 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  54.7 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.35 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  53.11 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.21 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 435 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.96 
 
 		 443 aa  411  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  53.07 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  52.39 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  54.41 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  52.83 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  54.87 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  52.05 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  54.87 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  55.13 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  52.86 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  54.05 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  54.33 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  51.43 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  54.2 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0658  AAA ATPase central domain protein  52.76 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0721035 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  53.11 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  51.69 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.31 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  52.15 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  50.48 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  53.72 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  52.04 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  52.04 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  52.32 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  52.04 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  51.56 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  50.96 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  52.27 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  51.92 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  51.8 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  51.96 
 
 		 443 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  52.87 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  51.8 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  47.51 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  53.04 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  52.21 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  49.52 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>