More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1668 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 463 aa  946    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  69.52 
 
 		 439 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  63.19 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  62.17 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  63.64 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  65 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  61.09 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  62.86 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  64.24 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  62.86 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  62.86 
 
 		 438 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  61.02 
 
 		 438 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  62.44 
 
 		 436 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  61.52 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  62.11 
 
 		 444 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  62.14 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  62.35 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  59.86 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  63.98 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  61.94 
 
 		 443 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  59.63 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  59.95 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  59.91 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  59.2 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  58.7 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  59.2 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  60.99 
 
 		 437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  61.37 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  60.24 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  63.4 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  59.29 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  60.24 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  62.65 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  65.47 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  60.91 
 
 		 437 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  56.55 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  61.15 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  61.24 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  60.95 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  60.95 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  61.65 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  55.81 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53.99 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  52.62 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.37 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.25 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.01 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.99 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.01 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.66 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.07 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.66 
 
 		 441 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 440 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  51.84 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  52.09 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  52.77 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  51.28 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  52.05 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  51.27 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  53.56 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>