More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1743 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  96.8 
 
 		 437 aa  838    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 437 aa  885    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  99.54 
 
 		 437 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  76.43 
 
 		 436 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  79.41 
 
 		 443 aa  697    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  76.32 
 
 		 436 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  78.49 
 
 		 442 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  65.6 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  65.45 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  63.24 
 
 		 437 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  65.08 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  63.01 
 
 		 437 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  64.85 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  64.15 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  64.85 
 
 		 443 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  64.78 
 
 		 444 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  63.55 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  63.66 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 		 436 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  62.87 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  61.34 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  63.45 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  62.41 
 
 		 440 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  61.97 
 
 		 447 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  62.27 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  63.66 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  62.9 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  62.19 
 
 		 437 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  62.73 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  64.22 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  60.38 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  64.91 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  61.64 
 
 		 437 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  60.95 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  62.65 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  60.91 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  61.59 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 		 437 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  59.72 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  59.27 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  54.42 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  53.54 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  54.06 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  53.43 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  53.43 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53.95 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  51.93 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  53.29 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  52.71 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  51.38 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  53.58 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.26 
 
 		 440 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  52.29 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.55 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  51.52 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>