More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1464 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  90.55 
 
 		 435 aa  811    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  75.84 
 
 		 435 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 440 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  81.88 
 
 		 437 aa  737    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  74 
 
 		 437 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  76.19 
 
 		 443 aa  670    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  75.53 
 
 		 444 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  82.11 
 
 		 437 aa  740    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  73.79 
 
 		 444 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  73.79 
 
 		 442 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  74.83 
 
 		 437 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  72.58 
 
 		 443 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  75.06 
 
 		 443 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  75.06 
 
 		 446 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  88.05 
 
 		 436 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  81.92 
 
 		 440 aa  723    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  78.04 
 
 		 436 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  84.4 
 
 		 438 aa  753    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  97.49 
 
 		 438 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  74 
 
 		 440 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 438 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  74.52 
 
 		 447 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  73.74 
 
 		 439 aa  680    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  72.79 
 
 		 437 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  73.12 
 
 		 437 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  69.2 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  65.32 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  62.93 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  62.86 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  64.37 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  63.29 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  63.91 
 
 		 442 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  64.07 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  64.37 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  63.45 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  65.16 
 
 		 436 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  59.27 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  62.77 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  61.08 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  62.84 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  62.95 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.91 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  56.19 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.13 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.86 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  54.05 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  53.86 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  51.02 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 440 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  52.86 
 
 		 436 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  53.43 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 443 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  51.38 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.36 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  51.25 
 
 		 474 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.05 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>