More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2660 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 439 aa  882    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  69.52 
 
 		 463 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  71.76 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  64.37 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  66.9 
 
 		 444 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  68.82 
 
 		 444 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  68.35 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  65.6 
 
 		 440 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 		 443 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  67.38 
 
 		 443 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 		 437 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  66.19 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  67.38 
 
 		 436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  66.11 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  65.96 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  65.8 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  65.95 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  67.38 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  67.38 
 
 		 442 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  65.38 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  64.75 
 
 		 442 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  65.32 
 
 		 438 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  68.57 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  67.55 
 
 		 481 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  65.71 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  65.02 
 
 		 440 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  65.02 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  64.57 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  63.28 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  66.67 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  66.67 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  68.79 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  65.79 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  63.53 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  67.14 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  64.69 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  62.5 
 
 		 435 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  63.59 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  65.13 
 
 		 437 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  60.43 
 
 		 439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  55.23 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.86 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  51.65 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.62 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.58 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.65 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.9 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.44 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.11 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  52.25 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  47.59 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  48.84 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.74 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  52.29 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.88 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  48.65 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  48.65 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  53.04 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  48.77 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  48.37 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  48.23 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>