More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1767 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  100 
 
 
435 aa  876    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  70.14 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  67.14 
 
 
439 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  66.44 
 
 
434 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  62.5 
 
 
431 aa  554  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  64.75 
 
 
443 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  63.72 
 
 
444 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  62.7 
 
 
443 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  64.22 
 
 
436 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  64.22 
 
 
437 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  62.44 
 
 
435 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  63.64 
 
 
436 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 
443 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  63.43 
 
 
446 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  64.78 
 
 
443 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  63.43 
 
 
444 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  65.57 
 
 
473 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  64.22 
 
 
437 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  64.22 
 
 
437 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  62.16 
 
 
438 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  63.92 
 
 
440 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  63.66 
 
 
436 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  62.61 
 
 
435 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  61.65 
 
 
463 aa  518  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  61.52 
 
 
437 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  62.95 
 
 
438 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  62.07 
 
 
440 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  61.47 
 
 
437 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  61.24 
 
 
437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  61.61 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  62.95 
 
 
438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  62.27 
 
 
442 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  61.61 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  63.57 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  66.59 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  62.24 
 
 
436 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 
437 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  62.53 
 
 
437 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  62.03 
 
 
447 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  63.07 
 
 
481 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 
439 aa  490  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  61.96 
 
 
439 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  60.76 
 
 
452 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  52.5 
 
 
440 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.69 
 
 
447 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  55.42 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  55.66 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  54.94 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 
434 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 
434 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  52.39 
 
 
437 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  53.95 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  54.7 
 
 
441 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
436 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  55.18 
 
 
441 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  54.7 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 
449 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 
436 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  51.84 
 
 
436 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
436 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  54.7 
 
 
441 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  54.24 
 
 
437 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  51.84 
 
 
436 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 
443 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
436 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  51.56 
 
 
437 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  54.16 
 
 
435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  52.31 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  53.1 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  53.75 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  52.84 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 
453 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  51.41 
 
 
434 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
455 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  52.63 
 
 
446 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  53.98 
 
 
441 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  52.4 
 
 
433 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.36 
 
 
444 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  53.98 
 
 
441 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 
436 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  53.41 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  53.04 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 
440 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.49 
 
 
440 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  53.96 
 
 
442 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 
440 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 
458 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 
458 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  52 
 
 
461 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  51.65 
 
 
430 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 
432 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 
442 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.263258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>