More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1298 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 455 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  74.89 
 
 		 436 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 437 aa  895    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  72.5 
 
 		 437 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  76.26 
 
 		 436 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  76.26 
 
 		 436 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  73.68 
 
 		 434 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  75.57 
 
 		 436 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  75.34 
 
 		 436 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  74.89 
 
 		 436 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  75.34 
 
 		 436 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  73.56 
 
 		 434 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  72.48 
 
 		 433 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  74.37 
 
 		 462 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 436 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  71.99 
 
 		 446 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  74.11 
 
 		 435 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  73.99 
 
 		 437 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  73.63 
 
 		 449 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  73.51 
 
 		 437 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  73.75 
 
 		 453 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  74.54 
 
 		 445 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  72.25 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  72.92 
 
 		 449 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  69.41 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  69.65 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  67.84 
 
 		 443 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  69.21 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  67.12 
 
 		 440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  69.21 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  70.88 
 
 		 442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  65.36 
 
 		 435 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  67.12 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  66.83 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  67.15 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  65.95 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  63.15 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  64.05 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  60.91 
 
 		 441 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  60.45 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  60.45 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  60.23 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  60.45 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  59.78 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  60.37 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  61.15 
 
 		 441 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  59.55 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  59.32 
 
 		 440 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  60.41 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  59.59 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  59.63 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  58.45 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  58.03 
 
 		 453 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  58.84 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  58.04 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  57.6 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  56.94 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  56.94 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  52.89 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  53.38 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  55.89 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  54.05 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  52.19 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  55.04 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  52.45 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  52.48 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  54.99 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  52.19 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  57.11 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  55.04 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  54.09 
 
 		 447 aa  445  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  55.05 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  53.49 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  52.8 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  52.48 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  55.05 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  52.45 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  52.57 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  53.02 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  53.26 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>