More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1728 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  71.3 
 
 		 436 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 455 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  98.85 
 
 		 434 aa  890    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 434 aa  899    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  71.53 
 
 		 436 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  71.3 
 
 		 436 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  71.5 
 
 		 434 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  71.3 
 
 		 436 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  71.06 
 
 		 436 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  71.3 
 
 		 436 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  75.12 
 
 		 433 aa  668    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  70.6 
 
 		 436 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  72.39 
 
 		 434 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  70.83 
 
 		 436 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  72.85 
 
 		 462 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  68.43 
 
 		 437 aa  618  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  69.74 
 
 		 437 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  65.03 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  66.19 
 
 		 437 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 		 437 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  66.67 
 
 		 453 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  66.19 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  65.36 
 
 		 449 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  64.87 
 
 		 440 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  65.97 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  64.29 
 
 		 449 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  65.32 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  61.11 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  65.01 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  65.87 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  63.79 
 
 		 442 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  64.35 
 
 		 442 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  63.72 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  62.74 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  62.35 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  60.43 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  60 
 
 		 443 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  59.45 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  59.45 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  58.01 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  59.86 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  58.47 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  59.91 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  58.89 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  58.66 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  58.31 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  59.29 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  55.97 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  57.86 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  58.29 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  56.26 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  55.61 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  55.13 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  56.88 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  56.44 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  56.21 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  52.91 
 
 		 455 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  54.27 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  53.07 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  53.07 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  53.58 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  52.07 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  52.39 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  53.58 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  52.56 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  52.56 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 443 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>