More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1122 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  77.33 
 
 		 447 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  73.66 
 
 		 435 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 443 aa  891    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  74.64 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  73.4 
 
 		 442 aa  621  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  73.16 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  70.16 
 
 		 432 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  71.26 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  69.52 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  69.75 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  72.97 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  70.88 
 
 		 446 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  69.37 
 
 		 449 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  69.62 
 
 		 453 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  67.84 
 
 		 437 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  68.42 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  68.18 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  65.27 
 
 		 440 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  69.32 
 
 		 445 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  67.95 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  65.81 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  66.59 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  66.27 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  66.27 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  66.27 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  65.8 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  68.9 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  65.09 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  65.8 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  65.8 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 455 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  65.8 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  65.43 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  64.27 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  60.42 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  61.43 
 
 		 447 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  60 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  60.61 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  60.37 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  60.79 
 
 		 441 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  62.95 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  60.23 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  60.14 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  58.17 
 
 		 453 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  60.47 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  59.91 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  61.11 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  60.23 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  60.14 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  61.86 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  59.44 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  59.63 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  59.63 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  60.51 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  58.45 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  59.76 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  56.74 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  58.12 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  55.48 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  55.48 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  53.95 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  55.61 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  55.61 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  53.29 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  54.38 
 
 		 443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  54.04 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  53.23 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  57.24 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  56.35 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  54.06 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  54.38 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  51.11 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  53.57 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  53.2 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  53.95 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  52.47 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  53.2 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  51.5 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>