More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2338 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 449 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  85.62 
 
 		 446 aa  765    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  80.6 
 
 		 437 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  85.97 
 
 		 445 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  93.1 
 
 		 435 aa  822    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  79.49 
 
 		 453 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  81.06 
 
 		 437 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  92.84 
 
 		 449 aa  840    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  72.92 
 
 		 437 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  71.03 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  72.75 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  68.58 
 
 		 437 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  72.27 
 
 		 436 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  69.98 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  71.8 
 
 		 436 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  71.56 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  71.8 
 
 		 436 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  71.56 
 
 		 436 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  71.33 
 
 		 436 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  70.8 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  70.92 
 
 		 433 aa  599  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  71.56 
 
 		 436 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  70.07 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  70.3 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  73.86 
 
 		 442 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  67.26 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  70.95 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  67.82 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  70.24 
 
 		 447 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  67.75 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  68.54 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  64.29 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  66.98 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  64.81 
 
 		 434 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  69.14 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 452 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  68.17 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  64.42 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  64.42 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  65.51 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  62.19 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  63.26 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  61.57 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  62.16 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  63.02 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  63.26 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  63.02 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  61.21 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  58.47 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  59.42 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  61.52 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  58.18 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  59.17 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  57.27 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  57.31 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  57.31 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  60.61 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  56.94 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  54.73 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  54.69 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  54.92 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  54.69 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  54.69 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  53.76 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  55.14 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  54.55 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  54.69 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  54.55 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  52.57 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  53.53 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  52.71 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  57.58 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>