More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6768 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6768  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 434 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  70.97 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  70.74 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  69.89 
 
 		 436 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  69.89 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  69.89 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  69.43 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  69.43 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  69.43 
 
 		 436 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  67.67 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  65.98 
 
 		 434 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  67.28 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  64.75 
 
 		 433 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  62.24 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  61.34 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  61.11 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  62.36 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  62.15 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  61.01 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  62.68 
 
 		 437 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  62.12 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  62.2 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  63.03 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  61.1 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  61.1 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  62.82 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  61.52 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  56.29 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  58.75 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  62.2 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  59.31 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  58.47 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  56.56 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  58.12 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  57.24 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  56.76 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  59.14 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  58.47 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  54.61 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  55.13 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  54.21 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  55.35 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  53.76 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  53.99 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.3 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  52.83 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  54.92 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  48.72 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  48.08 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  48.03 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  47.4 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  48.08 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  48.49 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  47.8 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  47.4 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  47.4 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  52.46 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  47.4 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  47.56 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  46.58 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2757  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  46.94 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  46.38 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  46.87 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  45.96 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  46.5 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  45.96 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>