More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0813 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00896  recombination protein  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  72.93 
 
 		 447 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  72.26 
 
 		 447 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  69.35 
 
 		 447 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  71.59 
 
 		 447 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  69.37 
 
 		 444 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  67.19 
 
 		 448 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  72.04 
 
 		 447 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  70.69 
 
 		 447 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  72.26 
 
 		 447 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  72.93 
 
 		 447 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  72.48 
 
 		 447 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  72.48 
 
 		 447 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  72.93 
 
 		 447 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  72.71 
 
 		 447 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  69.37 
 
 		 444 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  68.97 
 
 		 449 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 446 aa  924    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  72.93 
 
 		 447 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  71.36 
 
 		 447 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  71.59 
 
 		 447 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  68.3 
 
 		 449 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  67.86 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  65.03 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  65.48 
 
 		 443 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  65.26 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  65.62 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  64.67 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  63.98 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 443 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  63.31 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  62.81 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  64.9 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  63.53 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  62.5 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  62.86 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  62.5 
 
 		 443 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2757  recombination factor protein RarA  59.65 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  57.33 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  59.31 
 
 		 444 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  58.76 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  58.99 
 
 		 441 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  58.76 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  58.99 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  58.76 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  57.64 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  58.76 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  58.53 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  58.53 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  58.76 
 
 		 441 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  58.29 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  57.14 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  58.06 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  56.69 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  55.33 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1327  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  52.87 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  54.12 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  54.95 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  54.01 
 
 		 446 aa  458  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  52.57 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  54.31 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  53.57 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  53.21 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  52.8 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  51.5 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 427 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  53.29 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  53.52 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  51.81 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  51.11 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  52.96 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>