More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1327 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1327  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 469 aa  949    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  54.71 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  54.42 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  54.19 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  52.29 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  54.42 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  52.07 
 
 		 443 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  52.06 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  52.89 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  51.86 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  52.61 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.79 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  55.16 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  54.08 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.62 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  52.74 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  52.95 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.94 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  51.02 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2757  recombination factor protein RarA  46.36 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  53.38 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  50.12 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  52.24 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  48.61 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  49.08 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  48.52 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  48.07 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.35 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  46.74 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  48.75 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  48.97 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  45.68 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  51.92 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.28 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  47.59 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>