More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1401 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 451 aa  896    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  67.99 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  67.72 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  55.34 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  55.26 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  54.89 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  49.2 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  56.39 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  55.64 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  55.13 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  55.23 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  55.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  55.13 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  53.06 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 440 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  54.96 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  54.16 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  54.78 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  54.76 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.9 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  53.94 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  53.47 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  52.45 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  53.94 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  54.27 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  54.03 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  55.32 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  54.16 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  53.79 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  53.57 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53.96 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.37 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  54.27 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  54.59 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  55.06 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  51.62 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  57.45 
 
 		 459 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  53.52 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  52.48 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  55.26 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  52.61 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  55.1 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  49.16 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  55.26 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>