More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2242 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  72.16 
 
 		 440 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  76.19 
 
 		 435 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  71.75 
 
 		 441 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 448 aa  915    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  73.21 
 
 		 435 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  72.24 
 
 		 434 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  71.29 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  63.68 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  55.84 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  56.03 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  55.19 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  53.76 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  52.11 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  53.15 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  52.91 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.09 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  52.83 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  52.62 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  55.27 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  53.16 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  51.86 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.62 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  52.3 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  55.53 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  52.21 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.35 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  53.54 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  50.48 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  51.28 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  51.01 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.68 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  49.28 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.32 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  47.81 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.67 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.04 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.94 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  51.94 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  49.88 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  49.17 
 
 		 449 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  55.61 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.8 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  50.47 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  51.56 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  50.23 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  49.52 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  49.52 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  49.52 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  50.49 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  48.47 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  50.84 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>