More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1672 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 447 aa  908    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  55.23 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  55.81 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  54.48 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  52.91 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  55.9 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  54.4 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  55.3 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  54.91 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  54.25 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  56.02 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  54.08 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  54.67 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  56.64 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  54.25 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 446 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  53.52 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  53.29 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  54.12 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  53.99 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.09 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  56.9 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  53.5 
 
 		 440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  53.26 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.38 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.5 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  53.95 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  53.05 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  53.5 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  55.31 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  55.12 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  52.71 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  53.88 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  54.23 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  51.51 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  52.89 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  54.42 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  54.04 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  54.27 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  50.79 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  53.99 
 
 		 481 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  53.95 
 
 		 440 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  54.08 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  53.7 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  53.5 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  52.07 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  51.52 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  53.05 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 443 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  52.29 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  51.41 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  52.29 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 443 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  54.88 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  55.42 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.18 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  53.26 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  54.65 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  51.61 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  52.63 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  53.02 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  54.07 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>