More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0882 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  75.28 
 
 		 452 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  76.48 
 
 		 439 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 481 aa  967    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  67.13 
 
 		 434 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  65.45 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  67.55 
 
 		 439 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  64.84 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  63.76 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  64.71 
 
 		 436 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  64.37 
 
 		 438 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 		 437 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  66.67 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  64.38 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  63.96 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 438 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  63.66 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  63.51 
 
 		 437 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  65.05 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  64.81 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  65.16 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  63.3 
 
 		 435 aa  545  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  64.37 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  63.95 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  62.99 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  61.42 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  62.71 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  64.75 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  64.99 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  63.59 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  61.48 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  63.64 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  60.75 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  62.09 
 
 		 473 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  64.52 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  60.55 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  62.47 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  59.27 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  59.37 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  59.5 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  58.81 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  61.7 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  59.04 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  51.36 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.68 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  50.23 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  52.55 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  50.92 
 
 		 441 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.77 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  52.96 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  47.14 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.2 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.31 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  47.97 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  47.56 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.56 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.75 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  45.58 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  51.73 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  45.23 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  47.35 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.85 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  47.35 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.51 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>