More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2328 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 432 aa  891    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  65.49 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  65.34 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  62.06 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  64.81 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  64.08 
 
 		 434 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  63.68 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  62.77 
 
 		 435 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  54.61 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  50.79 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  54.36 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  52.71 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  51.13 
 
 		 457 aa  458  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  52.96 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  52 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  53.42 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  51.52 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  56.74 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  51.49 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  51.6 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  56.21 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  56.21 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  55.31 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  54.72 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  56.84 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  51.36 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.69 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  53.92 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.8 
 
 		 739 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.34 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  53.83 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  52.13 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.78 
 
 		 731 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  52.25 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.39 
 
 		 726 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  51.33 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  48.57 
 
 		 425 aa  418  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  49.65 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  51.21 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  52.28 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  51.32 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  50.48 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  48.7 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  51.21 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  48.56 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  49.46 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  52.57 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.44 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  49.28 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  48.44 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.35 
 
 		 735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  48.15 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  51.42 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 430 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>