More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3807 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  82.58 
 
 		 544 aa  834    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 505 aa  1018    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  81.47 
 
 		 485 aa  736    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  67.69 
 
 		 459 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  59.15 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  59.64 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  59.18 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  59.95 
 
 		 447 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  60.58 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  53.65 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  55.03 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  55.5 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  54.69 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  54.04 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.58 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.61 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  56.46 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  54.84 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  56.68 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  53.06 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  56.46 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  55.98 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  56.22 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  55.02 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  55.26 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  56.22 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  55.06 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  56.8 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  56.22 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  56.7 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  57.31 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  54.71 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.95 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  54.89 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  52.19 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  52.27 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  51.62 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  54.5 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  52.03 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  54.5 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  52.03 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  52.03 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  55.56 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.46 
 
 		 739 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  52.26 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.63 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  51.73 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  50.96 
 
 		 443 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  54.55 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  51.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  56.64 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  51.5 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  54.18 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  51.73 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>