More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2547 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  74.77 
 
 		 481 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 452 aa  910    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  76.91 
 
 		 439 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  66.51 
 
 		 439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  64.16 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  62.75 
 
 		 440 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  63.18 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  63.99 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  61.96 
 
 		 437 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  63.24 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  63.76 
 
 		 438 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  61.96 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 436 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  63.93 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  63.62 
 
 		 446 aa  538  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  63.98 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  61.82 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  66.27 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  63.59 
 
 		 443 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  61.28 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  60.91 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  61.75 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  62.59 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  64.93 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  62.19 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  61.35 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  60.32 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  62.8 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  60.9 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  60.54 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  60.09 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  60.82 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  61.7 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  61.36 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  65.95 
 
 		 444 aa  511  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  61.14 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  63.16 
 
 		 443 aa  511  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  61.26 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  60.41 
 
 		 436 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  60.68 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  61.02 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  60.76 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.68 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  46.71 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.69 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.82 
 
 		 441 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.84 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  51.93 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.69 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  52.42 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  51.51 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.21 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  50.72 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  51.82 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  50.85 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  49.31 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  49.31 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 442 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  45.27 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  46.35 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.01 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  49.44 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  49.27 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  45.87 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>