More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0621 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  76.2 
 
 		 437 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  76.43 
 
 		 437 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  76.66 
 
 		 437 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 436 aa  889    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  76.92 
 
 		 443 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  76.83 
 
 		 436 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  73.46 
 
 		 442 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  63.28 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  63.07 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  62.24 
 
 		 438 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  62.27 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  62.73 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  62.33 
 
 		 436 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  60.82 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  62.39 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  62.23 
 
 		 444 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  61.47 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  62.95 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  60.82 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  62.71 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  63.55 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  61.05 
 
 		 443 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  60.59 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  62.2 
 
 		 443 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  60.45 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  59.91 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  61.74 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  65.29 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  61.61 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  63.64 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  59.31 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  60.36 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  60.45 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  60.45 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  60 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  59.51 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  60.14 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  59.68 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  61.01 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  58.53 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  58.81 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  58.93 
 
 		 437 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  56.1 
 
 		 437 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  55.61 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  53.5 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  55.21 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  52.09 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  54.05 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  52.86 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  55.53 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  54.48 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53.1 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  51.68 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.12 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  52.22 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  53.4 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  53.15 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.27 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  50.47 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.76 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  49.55 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.1 
 
 		 447 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  50.9 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  52.86 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  50.72 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>