More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0497 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 473 aa  940    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  67.29 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  67.47 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  64.24 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  65.48 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  63.55 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  60.94 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  65.2 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  63.44 
 
 		 443 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  62.59 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  62.26 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  61.97 
 
 		 443 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  61.65 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  59.96 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  62.8 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  62.06 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  65.57 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  61.89 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  62.67 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  62.61 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  62.61 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  60.04 
 
 		 443 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  61.77 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  61.08 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  59.22 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  62.09 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  60.75 
 
 		 435 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  60.38 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  60.33 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  60.33 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  60.85 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  62.24 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  59.26 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  61.08 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  60.14 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  59.53 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  59.53 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  59.44 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  59.07 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  58.96 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  61.43 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  56.1 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  61.19 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  53.05 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  54.97 
 
 		 441 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.16 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  52.93 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  53.13 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.74 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  52.2 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  52.2 
 
 		 441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  49.33 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  52.26 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  51.25 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  51.84 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  51.02 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  51.28 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  47.66 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  52.41 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  46.06 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1496  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  48.75 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.82 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  48.42 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>