More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7127 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  73.32 
 
 		 443 aa  656    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  73.27 
 
 		 436 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 437 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  72.77 
 
 		 438 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  72.33 
 
 		 443 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  94.02 
 
 		 437 aa  784    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  73.72 
 
 		 444 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  73.62 
 
 		 437 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  73.38 
 
 		 444 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  73.58 
 
 		 442 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  81.88 
 
 		 447 aa  724    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  82.72 
 
 		 440 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  72.58 
 
 		 443 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  72.12 
 
 		 446 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  76.15 
 
 		 435 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  71.85 
 
 		 437 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  72.71 
 
 		 440 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  82.72 
 
 		 437 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  81.88 
 
 		 440 aa  715    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  74.02 
 
 		 436 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  72.87 
 
 		 435 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  71.62 
 
 		 437 aa  631  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  71.36 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  71.13 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  66.9 
 
 		 439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  68.82 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  64.61 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  60.42 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  61.5 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  64.2 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  63.07 
 
 		 481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  62.33 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  62.33 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  60.63 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  63.53 
 
 		 439 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  62.13 
 
 		 437 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  61.93 
 
 		 436 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  60.09 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  60.63 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  63.22 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  58.54 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  60.94 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  62.76 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  56.38 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  54.36 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  52.31 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  56.04 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  53.16 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  53.16 
 
 		 440 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  52.42 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  54.21 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.93 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.69 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.69 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.46 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  51.57 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.97 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.87 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  55.42 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.32 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.32 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.65 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  51.02 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  49.66 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.1 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>