More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2133 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 459 aa  940    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  58.39 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  56.98 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  55.19 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  55.3 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  54.88 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  55.1 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  55.5 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  56.37 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 485 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  51.93 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  50.45 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  52.05 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.17 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  54.84 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  54.86 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  53.23 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 438 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  53.99 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  52.31 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  55.76 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  53.18 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  52.96 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  52.01 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.92 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  54.14 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  52.46 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  51.25 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  49.89 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  50.45 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  51.25 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 430 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  52.05 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  52.76 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  54.2 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  50.68 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  53.26 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  52.08 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  56.91 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  52.46 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  50.33 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  51.38 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  52.08 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  51.11 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  51.11 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  52.24 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.96 
 
 		 726 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  51.39 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>