More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1192 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 445 aa  922    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  65.53 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  64.9 
 
 		 443 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  57.14 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  55.2 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  54.31 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  54.89 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  53.86 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.52 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  51.29 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  51.07 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.35 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  49.08 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  48.74 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 440 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  48.1 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1685  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  46.84 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  48.03 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  45.82 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  45.37 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  46.44 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  46.09 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  46.42 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  45.33 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  47.58 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  44.14 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  44.93 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  44.85 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  45.25 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>