More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0730 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  98.4 
 
 
437 aa  859    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  98.63 
 
 
437 aa  860    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  100 
 
 
437 aa  868    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  88.66 
 
 
444 aa  681    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  59.04 
 
 
435 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  59.08 
 
 
441 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  58.13 
 
 
463 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  56.74 
 
 
432 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  56.98 
 
 
435 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  56.32 
 
 
440 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  56.58 
 
 
434 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  54.13 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  50.91 
 
 
457 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 
457 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  50.11 
 
 
457 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  51.59 
 
 
447 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 
447 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  53.43 
 
 
458 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 
485 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 
439 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  48.11 
 
 
445 aa  423  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 
450 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.13 
 
 
441 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 
446 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.07 
 
 
447 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  48.55 
 
 
426 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 
420 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.96 
 
 
505 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  52.72 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
445 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.49 
 
 
739 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.95 
 
 
726 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 
447 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.12 
 
 
731 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.78 
 
 
459 aa  398  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 
441 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  51.66 
 
 
435 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.63 
 
 
429 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 
447 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  54.35 
 
 
427 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  48.79 
 
 
423 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
457 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 
453 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 
449 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  51.07 
 
 
461 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 
461 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.47 
 
 
437 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
444 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
442 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 
434 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  46.57 
 
 
419 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.46 
 
 
735 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
440 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.35 
 
 
734 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  53.1 
 
 
447 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  49.88 
 
 
432 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 
500 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  50 
 
 
442 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.88 
 
 
734 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.8 
 
 
733 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.16 
 
 
721 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  47.25 
 
 
453 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  45.41 
 
 
425 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
435 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 
451 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.34 
 
 
441 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  48.72 
 
 
449 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
447 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
455 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
447 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  48.84 
 
 
446 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
436 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  51.35 
 
 
425 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 
445 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 
454 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
447 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
447 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
447 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  53.23 
 
 
436 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  48.61 
 
 
442 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 
442 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50 
 
 
440 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 
447 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 
447 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.540733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>