More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1618 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 445 aa  914    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  68.16 
 
 		 447 aa  633  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  71.82 
 
 		 454 aa  621  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  67.11 
 
 		 446 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  65.02 
 
 		 457 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  67.19 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  65.72 
 
 		 453 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.55 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  52.48 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  52.24 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.08 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  49.76 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  48.96 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 441 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  46.4 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.93 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 441 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  46.8 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  47.73 
 
 		 440 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  46.06 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  47.66 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.55 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  47.22 
 
 		 437 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  47.36 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  48.73 
 
 		 435 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.6 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.1 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.7 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.73 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.12 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.72 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  46.23 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.35 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  46.71 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.2 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  48.2 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  45.92 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>