More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05640 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  100 
 
 		 425 aa  868    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  75.29 
 
 		 425 aa  682    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  71.13 
 
 		 426 aa  655    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  67.61 
 
 		 426 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  62.32 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  64.54 
 
 		 419 aa  559  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  60.24 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  60.8 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  57.78 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  53.66 
 
 		 447 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  51.77 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  52.01 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.66 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  50.96 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  52.24 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.57 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.88 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  46.12 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.11 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  46.41 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  47.56 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.53 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  45.82 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  43.39 
 
 		 447 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  45.35 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  45.91 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  45.37 
 
 		 453 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  45.3 
 
 		 444 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  47.47 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  45.97 
 
 		 485 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 436 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  46.27 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 		 447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  48.25 
 
 		 425 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  46.27 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  46.27 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  46.27 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  46.27 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.01 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  45.11 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  45.65 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  46.33 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  45.02 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  45.95 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 444 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  44.71 
 
 		 442 aa  359  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  44.18 
 
 		 443 aa  359  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.67 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  44.39 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  45.37 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  43.83 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  45.17 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>