More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0103 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  95.57 
 
 		 429 aa  828    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  76.51 
 
 		 439 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 429 aa  877    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  56.46 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  54.15 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.88 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  50.24 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  53.83 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  53.17 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  50.49 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  51.34 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  52.83 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.56 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.64 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.51 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 457 aa  372  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  49.75 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  49.26 
 
 		 433 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 462 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  47.73 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  47.73 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.93 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  48.01 
 
 		 453 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 		 447 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.88 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  48.37 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  45.67 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  45.88 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  45.88 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  47.73 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.21 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  45.11 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.13 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  47.01 
 
 		 437 aa  346  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  47.86 
 
 		 432 aa  346  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  44.86 
 
 		 447 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 440 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 462 aa  344  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  48.02 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  46.25 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  44.16 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  46.14 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  44.34 
 
 		 447 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  45.87 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  44.34 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>