More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0732 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 457 aa  937    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  72.36 
 
 		 447 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  68.39 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  66.29 
 
 		 453 aa  618  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  65.02 
 
 		 445 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  65.26 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  65.99 
 
 		 454 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  52.24 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  53.19 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  54.16 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  51.42 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.59 
 
 		 435 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 425 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.97 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  51.53 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  50.71 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.01 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.98 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.11 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.74 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.05 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.05 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  49.66 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  49.2 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  48.36 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  48.19 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  47.66 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  47.44 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  51.91 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  47.14 
 
 		 436 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  47.69 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  46.43 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  45.43 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  49.02 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.33 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  46.99 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  48.31 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  46.84 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.04 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  46.01 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  46.25 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  47.63 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>