More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1103 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 434 aa  889    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  57.28 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  58.49 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  57.78 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  56.74 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  56.67 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  56.9 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  54.05 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.86 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  53.81 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.56 
 
 		 435 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.28 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.89 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.14 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.41 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  49.14 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  47.8 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.79 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  50.75 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  48.57 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.15 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  47.11 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  47.58 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  48.39 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  48.01 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  48.39 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  47.78 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  44.5 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  46.33 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 437 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  48.7 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  48.89 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  47.02 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  46.54 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  47.11 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  46.77 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.97 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.91 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.32 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1766  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  46.78 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  46.77 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  45.43 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.37 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.14 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  44.99 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  45.63 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.78 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  44.95 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.57 
 
 		 438 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  45.37 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  48.44 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  46.06 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>