More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1333 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 500 aa  975    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  69.27 
 
 		 436 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  66.9 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  66.9 
 
 		 436 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  61.34 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  61.94 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  65.97 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  61.45 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  64.72 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  61.18 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  65.18 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  62.56 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  60.75 
 
 		 519 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  65.52 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  63.36 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  63.47 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  62.65 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  62.65 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  62.65 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  61.52 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  58.9 
 
 		 456 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  62.06 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  61.66 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  61.14 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  61.97 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  61.32 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  59.95 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  58.21 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  60.98 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  61.5 
 
 		 465 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  60.76 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  59.15 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  57.97 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  56.17 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  58.89 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  54.84 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.73 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  52.93 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  60.94 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.48 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.71 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.45 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  51.49 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.45 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  49.53 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  47.3 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.09 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.47 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  48.75 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  47.33 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  47.83 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.7 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  44.05 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 		 420 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.15 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  46.81 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.76 
 
 		 731 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  46.44 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.95 
 
 		 463 aa  354  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.13 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  46.26 
 
 		 432 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>