More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1040 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 429 aa  828    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  55.35 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  56.28 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  54.48 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  55.94 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  54.36 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  53.53 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.41 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  52.93 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  52.62 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  53.02 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.31 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  53.14 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  56.97 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  51.47 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  51.61 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  52.35 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  51.6 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  49.64 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.07 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  52.37 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  47.61 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.2 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  57.27 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  52.57 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  53.67 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  51.41 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  51.99 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  48.01 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  51.94 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.62 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  57.34 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  55.13 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.8 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  52.98 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  52.86 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  49.77 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  53 
 
 		 445 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  57.42 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.7 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  53.37 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  51.62 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.21 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.85 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  55.66 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  50.69 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  53.51 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  48.21 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  49.33 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  54.46 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  49.53 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>