More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1974 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 456 aa  894    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  70.11 
 
 		 446 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  73.13 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  70.61 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  70.61 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  70.61 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  73.03 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  71.83 
 
 		 448 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  70.27 
 
 		 452 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  71.52 
 
 		 457 aa  551  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  68.19 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  66.51 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  61.74 
 
 		 519 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  64.94 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  63.49 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  63.51 
 
 		 502 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  58.39 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  65.73 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  64.04 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  64.24 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  64.52 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  65.96 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  63.23 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  64.13 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  63.96 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  62.44 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  60.94 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  63.33 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  62.65 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  60.89 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  60.26 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  60.97 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  64.37 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  57.63 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  58.68 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  62.73 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  55.81 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.31 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  52.87 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.56 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  60.47 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  52.36 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.4 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.05 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.59 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.68 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.1 
 
 		 739 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  50.86 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  50.84 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.79 
 
 		 734 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  50.99 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.03 
 
 		 734 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.03 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  46.79 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.28 
 
 		 726 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.8 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.33 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.15 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.05 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.87 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.64 
 
 		 721 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.22 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  47.91 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.04 
 
 		 453 aa  358  8e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.02 
 
 		 735 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.1 
 
 		 733 aa  356  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  49.15 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  49.26 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.24 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  44.26 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  44.89 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  46.3 
 
 		 423 aa  349  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  49.4 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>