More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2404 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 456 aa  898    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  65.04 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  72.51 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  65.81 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  66.01 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  62.83 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  70.45 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  64.22 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  65.12 
 
 		 448 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  64.46 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  64.46 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  64.46 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  66.35 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  65.52 
 
 		 500 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  68.79 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  65.72 
 
 		 502 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  60.94 
 
 		 456 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  65.27 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  69.09 
 
 		 456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  64.81 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  65.17 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  62.34 
 
 		 490 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  64.81 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  63.56 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  63.13 
 
 		 494 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  60.04 
 
 		 519 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  64.22 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  64.47 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  67.45 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  63.57 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  64.64 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  62.33 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  60.6 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  59.83 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  61.75 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  55.61 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 450 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  52.69 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.44 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  54.63 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  63.71 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.07 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.1 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.44 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  50.86 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  53.58 
 
 		 447 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  51.19 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  49.17 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.73 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  49.32 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.03 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.82 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.48 
 
 		 731 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.26 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50.8 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.6 
 
 		 733 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.26 
 
 		 735 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.41 
 
 		 457 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.92 
 
 		 721 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  45.22 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  45.45 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  46.51 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>