More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0832 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  71.82 
 
 		 445 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 454 aa  937    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  66.97 
 
 		 447 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  65.99 
 
 		 457 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  66.97 
 
 		 446 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  67.38 
 
 		 453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  65.99 
 
 		 449 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  52.61 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  51.42 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  50.83 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  50.95 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  49.65 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.97 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.21 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  48.59 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.08 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.36 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  48.44 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50.72 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.16 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.6 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.51 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  47.48 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47.32 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  47.61 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.21 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  47.61 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  47.61 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  46.35 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  47.04 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  47 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  49.03 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.24 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1843  recombination factor protein RarA  46.7 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0939319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.47 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  47.3 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  45.93 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  44.76 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>