More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0420 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 423 aa  866    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  74.94 
 
 		 423 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  63.27 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  63.79 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  62.12 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  62.88 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  60.24 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  62.35 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  57.89 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  56.46 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  57.01 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  54.05 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  54.87 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.78 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  51.44 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.94 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.3 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.3 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.23 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  50.62 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  47.72 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  49.15 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50.25 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  48.66 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  48.91 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.8 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  51.88 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  49.88 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  46.65 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  45.67 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2338  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 449 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.76 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 443 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  48.18 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  48.18 
 
 		 436 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  48.23 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  48.56 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  45.58 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  48.27 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  48.06 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  48.37 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  47.61 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  45.35 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  45.35 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>