More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0257 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  77.67 
 
 		 429 aa  670    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 439 aa  895    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  76.51 
 
 		 429 aa  664    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  56.67 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  55.16 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  53.61 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.43 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  54.41 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  51.44 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  50.72 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  49.02 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50.75 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  49.02 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.1 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.84 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.57 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.81 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.88 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.15 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  47.33 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4080  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  45.99 
 
 		 447 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  46.91 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  45.98 
 
 		 447 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.17 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.15 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  45.97 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 		 462 aa  355  6.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  45.97 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.9 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 		 430 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.15 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  46.62 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  47.07 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 		 437 aa  352  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  43.9 
 
 		 440 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  48.22 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.33 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  47.52 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  49.01 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 		 441 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.43 
 
 		 439 aa  349  6e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  48.29 
 
 		 425 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.34 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.16 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  46.91 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  42.62 
 
 		 739 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.3 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  47.83 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.39 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.29 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  45.45 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  45.45 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>