More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0626 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  74.66 
 
 		 447 aa  697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 453 aa  943    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  66.97 
 
 		 457 aa  628  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  68.68 
 
 		 446 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  69.06 
 
 		 449 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  63.68 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  64.82 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  55.82 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  55.48 
 
 		 419 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  53.41 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 435 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  53.26 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  52.01 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.36 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.27 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  51.6 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  51.07 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  50.49 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.05 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  48.85 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  49.02 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.86 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  48.5 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.97 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.52 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.13 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  46.21 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.19 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  47.73 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  47.73 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  49.53 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  48.44 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  47.29 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  46.86 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1873  recombination factor protein RarA  48.01 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  47.97 
 
 		 440 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  47.73 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.65 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 430 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  49.07 
 
 		 442 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.96 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  49.07 
 
 		 442 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  47.61 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  47.33 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  46.92 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  46.64 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  47.12 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  48.23 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  48.32 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  45.22 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.05 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.39 
 
 		 731 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  46.65 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>