More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0041 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 459 aa  928    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  78.81 
 
 		 462 aa  708    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  60.96 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  57.63 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  60.36 
 
 		 484 aa  481  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  56.71 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  55.43 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  57.94 
 
 		 490 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  54.75 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  60.27 
 
 		 478 aa  461  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  56.99 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  55.76 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  55.76 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  55.76 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  58.02 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  60.75 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  57.8 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  57.18 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  57.28 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  58.94 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  57.73 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  52.84 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  53.59 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  56.32 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  55.21 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  56.88 
 
 		 466 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  55.61 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.22 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  51.75 
 
 		 519 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  52.42 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  56.42 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.88 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  53.65 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  52.52 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  53.2 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.93 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.99 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  46.87 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  51.76 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.16 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.71 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.29 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  57.97 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50.34 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  48.37 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.5 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  47.69 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.85 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  49.17 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  48.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.05 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  46.33 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  48.45 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  47.7 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  47.7 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.17 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  45.06 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.54 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 455 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  47 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  49.44 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.6 
 
 		 446 aa  364  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  45.9 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  46.91 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.22 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.51 
 
 		 453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  47 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  47.98 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>