More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0463 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 440 aa  899    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  52.39 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  51.48 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  51.13 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51.23 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  51.99 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  50.47 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.08 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 440 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  49.53 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.62 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.7 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.16 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.79 
 
 		 739 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.16 
 
 		 726 aa  405  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.1 
 
 		 731 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.21 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.49 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.62 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  48.43 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.87 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  48.7 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  47.02 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.45 
 
 		 735 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.21 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  44.39 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.12 
 
 		 733 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.15 
 
 		 721 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  44.06 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  46.43 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  46.8 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  45.06 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  45.87 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  44.47 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  46.34 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.55 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.65 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.47 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  47.59 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  43.69 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  47.03 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.34 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.57 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  43.15 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  44.24 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  44.9 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  45.18 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  43.43 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  44.88 
 
 		 447 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.92 
 
 		 416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  44.5 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  43.6 
 
 		 443 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  45.73 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  46.19 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  43.36 
 
 		 443 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 443 aa  362  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 445 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  43.58 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  44.29 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  44.44 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  44.04 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 441 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  43.91 
 
 		 451 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>