More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2304 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  71.25 
 
 
735 aa  998    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.92 
 
 
734 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.51 
 
 
734 aa  802    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  78.13 
 
 
733 aa  1104    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  100 
 
 
721 aa  1441    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.39 
 
 
731 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  56.87 
 
 
739 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  65.85 
 
 
455 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  56.09 
 
 
726 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  63.78 
 
 
458 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  59.18 
 
 
441 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  52.79 
 
 
429 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  54.17 
 
 
450 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 
429 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 
429 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  51.48 
 
 
428 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  53.1 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  55.04 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  56.41 
 
 
441 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 
438 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  55.27 
 
 
435 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 
444 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  52.49 
 
 
422 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 
432 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 
441 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.36 
 
 
432 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  51.32 
 
 
459 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 
432 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
435 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.19 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.43 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.41 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 
457 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 
440 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  46.51 
 
 
428 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 
457 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 
434 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 
435 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  50.46 
 
 
446 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  47.36 
 
 
431 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.97 
 
 
446 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.85 
 
 
463 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 
485 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
448 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  46.15 
 
 
440 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 
505 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  45.93 
 
 
416 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  49.65 
 
 
435 aa  382  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 
443 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  49.21 
 
 
459 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  47.04 
 
 
447 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.04 
 
 
443 aa  368  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  48.03 
 
 
461 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 
451 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
447 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.41 
 
 
456 aa  364  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 
437 aa  363  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 
437 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 
437 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  49.41 
 
 
445 aa  360  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.59 
 
 
447 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 
459 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
465 aa  356  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
434 aa  355  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 
446 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 
434 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.97 
 
 
439 aa  353  8e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  45.08 
 
 
447 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 
448 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 
463 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  46.34 
 
 
429 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  45.59 
 
 
428 aa  349  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  46.63 
 
 
423 aa  349  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 
428 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  349  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  45.39 
 
 
444 aa  349  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  47.03 
 
 
461 aa  349  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 
544 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 
519 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  45.34 
 
 
428 aa  348  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 
429 aa  348  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
428 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  45.33 
 
 
453 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  40.55 
 
 
435 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 
445 aa  345  2e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 
443 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.14 
 
 
446 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  52.44 
 
 
444 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 
441 aa  343  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  43.91 
 
 
443 aa  343  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  45 
 
 
445 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 
443 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  44.73 
 
 
443 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>