More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_01421 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  97.68 
 
 		 734 aa  1468    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.96 
 
 		 733 aa  774    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.51 
 
 		 721 aa  783    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 734 aa  1499    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  57.59 
 
 		 735 aa  874    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  66.45 
 
 		 455 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.11 
 
 		 731 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.09 
 
 		 739 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.6 
 
 		 726 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  60.52 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  56.88 
 
 		 441 aa  512  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  53.49 
 
 		 429 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  52.33 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  54.23 
 
 		 428 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  52.79 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 441 aa  459  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  50.79 
 
 		 438 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.06 
 
 		 435 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 450 aa  429  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 444 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 422 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  48.84 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.47 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 432 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.76 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 485 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  46.26 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.62 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.13 
 
 		 463 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.73 
 
 		 432 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.27 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.85 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.06 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  46.64 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  47.29 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.88 
 
 		 416 aa  382  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.56 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.03 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  47 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.71 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.7 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.98 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  47.23 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  46.54 
 
 		 423 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.85 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  43.16 
 
 		 461 aa  365  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 437 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 437 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  42.01 
 
 		 544 aa  363  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  46.39 
 
 		 447 aa  363  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  44.96 
 
 		 447 aa  361  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  43.58 
 
 		 459 aa  361  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  45.04 
 
 		 461 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  47.07 
 
 		 434 aa  360  7e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  48.06 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  45.01 
 
 		 444 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  43.18 
 
 		 447 aa  353  7e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  47.12 
 
 		 445 aa  353  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  46.93 
 
 		 463 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.16 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  45.05 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  43.65 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  40.55 
 
 		 443 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  45.87 
 
 		 445 aa  350  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  46.12 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  44.89 
 
 		 453 aa  348  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 443 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  47.23 
 
 		 477 aa  348  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  43.55 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  42.2 
 
 		 442 aa  347  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.69 
 
 		 435 aa  347  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  45.2 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  47.18 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  47.46 
 
 		 502 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  42.11 
 
 		 447 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  44.61 
 
 		 434 aa  345  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 429 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  40.55 
 
 		 443 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 455 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  44.71 
 
 		 429 aa  344  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  44.84 
 
 		 436 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  42.63 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>