More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0388 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.83 
 
 		 734 aa  783    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  57.22 
 
 		 739 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  67.3 
 
 		 735 aa  952    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 733 aa  1475    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  78.13 
 
 		 721 aa  1102    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.96 
 
 		 734 aa  790    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  58.33 
 
 		 731 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  64.14 
 
 		 455 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.23 
 
 		 726 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  62.87 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  57.82 
 
 		 441 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  52.05 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  51.14 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  50.68 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  51.38 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  52.18 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  55.71 
 
 		 441 aa  455  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  54.57 
 
 		 435 aa  452  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 437 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  51.16 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  52.49 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  52.03 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  50.44 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.38 
 
 		 435 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.65 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.84 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  47.36 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  45.35 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  50 
 
 		 446 aa  396  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.2 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  48.24 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  50.12 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.3 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  49.3 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.39 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.12 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.04 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.98 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  45.97 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  49.65 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 437 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 		 447 aa  360  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 544 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  46.9 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  47.22 
 
 		 448 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  48.1 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  353  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 		 463 aa  353  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  45.79 
 
 		 434 aa  353  8.999999999999999e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 428 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  44.95 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 428 aa  351  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 428 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 428 aa  350  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  47.97 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  46.14 
 
 		 423 aa  347  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  52.88 
 
 		 444 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 459 aa  347  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 456 aa  346  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  44.76 
 
 		 445 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  49.3 
 
 		 427 aa  343  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  40.79 
 
 		 435 aa  343  7e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.1 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  43.31 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  49.07 
 
 		 441 aa  343  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 443 aa  342  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  43.58 
 
 		 447 aa  342  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  43.72 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  46.71 
 
 		 494 aa  342  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  44.16 
 
 		 444 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>