More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1199 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 428 aa  862    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.03 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.3 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.35 
 
 		 733 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.51 
 
 		 721 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  46.44 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.8 
 
 		 735 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.9 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.29 
 
 		 734 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.13 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  47.26 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.8 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.29 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  45.68 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  44.8 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  44.14 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  44.9 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.64 
 
 		 435 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.89 
 
 		 726 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  45.67 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  45.31 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  44.94 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  43.59 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  46.34 
 
 		 446 aa  362  8e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  44.98 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  45.63 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  45.37 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  44.32 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  45.43 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  46.01 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  45.13 
 
 		 426 aa  355  6.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  43.25 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.89 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.02 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  46.14 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  44.7 
 
 		 449 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  44.26 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  41.42 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.89 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.09 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.1 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  45.41 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  43.85 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  42.33 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  44.1 
 
 		 419 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  43.63 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  44.15 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  42.28 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.2 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  44 
 
 		 425 aa  338  8e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  40.76 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  43.53 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  40.54 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  43.39 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  39.2 
 
 		 519 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  41.03 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  42.43 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  44.95 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  40.84 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  43.2 
 
 		 441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.57 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  40.45 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  39.36 
 
 		 544 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  40.58 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  43.84 
 
 		 423 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  42.14 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  41.78 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>