More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0488 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 434 aa  888    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  70.35 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  64.65 
 
 		 432 aa  558  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  61.39 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  61 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  61 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  60.28 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  60.24 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  61.41 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  59.71 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  49.3 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  49.15 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  50.98 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  50.98 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.68 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.82 
 
 		 731 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.8 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  48.95 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48.29 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.07 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.5 
 
 		 739 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  47.09 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.83 
 
 		 735 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  46.17 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  47.18 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.44 
 
 		 726 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.83 
 
 		 721 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  45.92 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.79 
 
 		 733 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  45.52 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  45.61 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  47.27 
 
 		 494 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  43.72 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.61 
 
 		 734 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  42.56 
 
 		 451 aa  345  8.999999999999999e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.61 
 
 		 734 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  45.63 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  46.08 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  45.61 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  43.69 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  47.1 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  45.96 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.56 
 
 		 485 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  43.17 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  47.1 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  44.26 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44.85 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  44.15 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  45.25 
 
 		 473 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  43.53 
 
 		 440 aa  329  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  41.95 
 
 		 455 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  45.23 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  45.5 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  44.84 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  42.49 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 410 aa  326  6e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  46.87 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.02 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  42.03 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  41.23 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  40.81 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  41.85 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  45.28 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  43.95 
 
 		 484 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  45.17 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  41.57 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  45.98 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  45.59 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  45.07 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  44.36 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>